Варианты SARS-COV-2

Существует много вариантов тяжелого острого респираторного синдрома Коронавирус 2 (SARS-COV-2), вирус, который приводит к тому, что заболевание коронавируса в 2019 году (Covid-19). Некоторые считаются или были объявлены имеют особое значение, поскольку они могут повысить трансмиссионность повысить вирулентность или снизить эффективность вакцин, направленных против них. Эти варианты способствуют сохранению. Пандемия Covid-19.По состоянию на май 2023 года, Всемирная организация здравоохранения было обозначено только Omicron и его собственный вариант [неразличимым].

Обзор

Происхождение SARS-COV-2 не было определено. Однако появление SARS-COV-2 может быть результатом события рекомбинации между SARS-похожими на летучими мышами COV и Pangolin COV с помощью межвидовой передачи. Самые ранние доступные геномы из вируса SARS-COV-2 были собраны у пациентов в декабре 2019 года, и китайские исследователи сравнивали эти ранние геномы с штаммами коронавируса летучих мышей и панголина для оценки наследственного типа коронавируса человека; Определенный тип родового генома помечен "S ", а его доминирующий производный тип помечен "L ", чтобы отразить мутантное изменение аминокислот. Независимо от западных исследователей провели аналогичный анализ, но назвал наследственный тип как "a " и полученный тип как "b ". Озабоченность, помеченная Всемирной организацией здравоохранения как варианты альфа, бета, гамма, дельта и омикрона в 2021 году.На ранних стадиях пандемии относительно низкое количество инфекций (по сравнению с более поздними стадиями пандемии) приводит к меньшему количеству возможностей для мутаций в вирусном геноме и, следовательно, меньше шансов на различные изменения. Если мутации встречаются реже. также необычно наблюдать за мутациями в белке S в области рецептор-связывающего домена (RBD), который взаимодействует с ACE2.

Со временем эволюция генома SARS-COV-2 (через случайные мутации) приводила к мутированным образцам вируса (то есть генетической вариации), которые, как было установлено, являются более трансмиссируемыми, естественным образом выбираются. Альфа-варианты и дельта наблюдались, что они более трансмиссируются, чем ранее идентифицированные штаммы.Некоторые варианты SARS-COV-2 считаются тревожными, поскольку они поддерживают (или даже увеличивают) свою репликативную пригодность перед лицом растущего иммунитета популяции либо путем восстановления после инфекции, либо за счет инокулированных вакцин. Некоторые тревожные варианты показывают мутации в RBD белка S ПолемВ приведенной ниже таблице представлена ​​информация и относительные уровни риска для текущих и ранее распространенных вариантов, вызывающих озабоченность (ЛОС). Если не указано иное, эти интервалы предполагают 95% доверие или уровень достоверности. На этот раз из -за ограниченной доступности данных исследований, все оценки являются приблизительными. Не было никаких изменений в точности теста для альфа, бета, гамма и дельта, некоторые MAb сохраняли нейтрализующие активность антител. Тесты PCR продолжают обнаруживать варианты Omicron.